Emulsion PCR全面应用于GS-Sequencing内生菌测序



作为GS-Sequencing植物内生菌测序技术的重要组成部分,微滴乳液PCRePCR, emulsion PCR or Micelle PCR)通过将单一模板DNA与微量的PCR缓冲体系分配到独立单元完成PCR反应。与传统的PCR相比,ePCR增加了一步分液操作,将已经混合好的包含引物、模板、DNA聚合酶的PCR反应体系物理分割成为了众多微小独立的油包水反应体系。在分配过程中,引物、酶等组分过量,而模板不过量。模板DNA分子随机进入到各个独立反应体系中,经过PCR扩增后,包含模板的体系完成扩增,不包含模板的体系无扩增。

PCR扩增完成后,通过有机醇破坏有机相液滴结构,最终通过离心在水相反应体系中得到PCR扩增产物。通过ePCR获得的扩增产物与传统PCR扩增产物的优势在于可最大程度降低嵌合体的产生,并且每个模板DNA在同样的扩增条件下可获得最大效率的扩增,准确地反映样本的实际状态,特别适合于有植物等宿主干扰下的扩增子测序。




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